Lors de la première réunion du Conseil d'administration de l'agence, tenue à Marrakech le 14 février 2000, S.M le Roi Mohamed VI, souverain du Maroc, président du Comité Al Qods a souligné dans son allocution d'ouverture que l'Agence Bayt Mal Al Qods :
"Est une institution qui assume un rôle efficace et efficient dans la préservation de l'identité de la ville d'Al Qods et la défense des droits de ses habitants." Il a affirmé son souci à poursuivre les travaux de l'agence et appelé les Etats à mettre à sa disposition les moyens modernes de gestion et de planification. Si la cause d’Al Qods revêt une dimension religieuse du fait qu’elle a toujours été un espace ouvert à toutes les religions monothéistes, elle a en outre une portée politique.
Et de préciser que cette question concerne, au même titre, le monde islamique et le monde chrétien. La ville d'Al-Qods a toujours été, à travers l’histoire, un espace de rencontre et de cohabitation entre les religions, les civilisations et les cultures.

Se basant sur les résolutions et les recommandations du comité de tutelle dans sa première, seconde et troisième réunions tenues respectivement le 10 mars 1999, les 22-23 juin 2001 et le 20 décembre 2004,
A la lumière des résolutions et recommandations du conseil d'administration de l'agence dans sa première réunion à Marrakech du 14 février 2000, il a été décidé de faciliter la tâche au Directeur général pour prendre les contacts nécessaires pour mener à bien sa mission qui consiste à mobiliser les moyens financiers pour le compte de l'agence, sensibiliser ses citoyens à la nécessité d'apporter appui à la ville d'Al Qods et à ses habitants et à organiser des campagnes de vaste envergure au profit de l'Agence Bayt Mal Al Qods Acharif.
Dans le droit fil de ces objectifs et résolutions, et depuis ma nomination par SM. Le Roi Mohamed VI, Président du Comité Al Qods, en tant que Directeur général de l'Agence Bayt Mal Al Qods, j'ai entrepris l'élaboration d'un plan d'action pour les années à venir que je soumets à Votre Majesté, Président du Comité Al Qods, et que nous soumettons après Votre haute approbation aux Etats membres de l'Organisation de la Conférence islamique pour y émettre leurs avis et pour en assurer la mise en œuvre dans les meilleures conditions, ensuite nous soumettrons sa version définitive aux regards de la première réunion du comité de tutelle pour adoption.
Nous prions le Tout-puissant de guider nos pas et de couronner de succès nos efforts au service de la ville d'Al Qods Acharif, ses habitants et la mosquée Al Aqsa et réaliser les objectifs pour lesquels l'Agence Bayt Mal Al Qods a été créée sous la supervision du Président du Comité Al Qods, S.M le Roi Mohamed VI.Puisse Dieu assister Sa majesté par ses frères les rois et présidents des Etats islamiques auxquels nous souhaitons plein succès dans leur œuvre visant à libérer la ville sainte et permettre aux musulmans de faire leur prière à la Mosquée Al Aqsa dont l’enceinte est bénie par Dieu.
Cette stratégie couvre quatre axes et sera réalisée sur neuf ans répartis ainsi :
1- à court terme d'une durée d'une année qui s’est achevé le 31 décembre 2006
2- à moyen terme sur trois ans (du 1er janvier 2007 au 31 décembre 2009)
3- à long terme sur cinq ans (du 1er janvier 2010 au 31 décembre 2014).
Axes de la stratégie
Axe 1 : réalisation de la stratégie à court terme sur une année
La stratégie est axée sur les points suivants :
1- Mise à niveau de la gestion de l’agence et sa restructuration
2- Gestion bancaire et financière
3- Mise à niveau technologique de l’agence
4- Soutien financier de l’agence
5- Domaines de dépenses et d’intervention

Axe 2 : réalisation de la stratégie à moyen terme sur trois ans
La stratégie traite les points suivants :
1- doter l’agence des ressources humaines et des équipements nécessaires
2- dispositions financières de motivation et diversification des recettes
3- mise en place de l’administration électronique
4- donations des pays et populations
- médias et communication
- associations de la société civile et secteur privé
5- Projets pouvant être réalisés à cette période
Axe 3 : exécution des stratégies à long terme sur 5 ans
La stratégie est axée sur les points suivants :
1- Vaste activité culturelle
2- Ouverture sur le monde chrétien
3- Ouverture sur la communauté arabo-islamique en Europe et en Amérique
4- Coordination entre les instances publiques opérant dans le domaine de la collecte de dons
5- Projets de l’agence et domaine d’intervention sur le long terme.